Preview

Лечащий Врач

Расширенный поиск

Роль микробиома дыхательных путей в респираторном здоровье

Полный текст:

Аннотация

В предлагаемом обзоре обобщены последние достижения в области изучения респираторной микробиоты, взаимосвязи микробиома верхних дыхательных путей и легкого, обсуждения возможных механизмов влияния микробиома на астму и аллергию. Идентификация не только патогенных бактерий, но и комменсалов в дыхательных путях и желудочно-кишечном тракте (легочно-кишечная ось) - инновационный подход к выяснению их роли в развитии воспаления и модуляции иммунного ответа при респираторной аллергии.

Об авторах

Н. Г. Астафьева
ФГБОУ ВО СГМУ им. В. И. Разумовского МЗ РФ
Россия


Д. Ю. Кобзев
Лидс Тринити университет
Россия


И. В. Гамова
ФГБОУ ВО СГМУ им. В. И. Разумовского МЗ РФ
Россия


И. А. Перфилова
ФГБОУ ВО СГМУ им. В. И. Разумовского МЗ РФ
Россия


Е. Н. Удовиченко
ФГБОУ ВО СГМУ им. В. И. Разумовского МЗ РФ
Россия


Л. В. Скучаева
ФГБОУ ВО СГМУ им. В. И. Разумовского МЗ РФ
Россия


И. Э. Михайлова
ФГБОУ ВО СГМУ им. В. И. Разумовского МЗ РФ
Россия


Список литературы

1. Bunyavanich S., Schadt E. E. Systems biology of asthma and allergic diseases: a multiscale approach // J Allergy Clin Immunol. 2015 Jan; 135 (1): 31-42. DOI: 10.1016/j.jaci.2014.10.015.

2. EAACI White Book, on Research, Innovation and Quality Care / Published by the European Academy of Allergy and Clinical Immunology. 2018.

3. Kary Mullis. The Polymerase Chain Reaction. Nobel Lecture. Dec. 8. 1993. LEX PRIX NOBEL. The Nobel Prizes. Almqvist and Wiksell Int., Stockholm, Sweden.

4. Moraes F., G?es A. A decade of human genome project conclusion: Scientific diffusion about our genome knowledge // Biochem Mol Biol Educ. 2016, May 6; 44 (3): 215-223. DOI: 10.1002/bmb.20952.

5. Methе B. A., Nelson K. E., Pop M. et al. A framework for human microbiome research // Nature. 2012, Jun 14; 486 (7402): 215-221. DOI: 10.1038/nature11209.

6. The Human Micorbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome // Nature. 2012, Jun 13; 486 (7402): 207-214. DOI: 10.1038/nature11234.

7. Jason L. P., Galeb A. A., Curtis H. The healthy human microbiome // Genome Med. 2016; 8: 51. Published online 2016. Apr. 27. DOI: 10.1186/ s13073-016-0307-y.

8. Turnbaugh P. J., Ley R. E., Hamady M., Fraser-Liggett C. M., Knight R., Gordon J. I. The human microbiome project // Nature. 2007; 449: 804-810.

9. Human Microbiome Project: Diversity of Human Microbes Greater Than Previously Predicted. ScienceDaily. Retrieved 8 March 2012.

10. Human Microbiome Project - Home | NIH Common Fund. commonfund.nih.gov. Retrieved 2018-04-15.

11. Handelsman J. Metagenomics: application of genomics to uncultured microorganisms // Microbiol Mol Biol Rev. 2004; 68: 669-685.

12. Handelsman J., Rondon M. R., Brady S. F., Clardy J., Goodman R. M. Molecular biological access to the chemistry of unknown soil microbes: a new frontier for natural products // Chem Biol. 1998, Oct; 5 (10): 245-249.

13. National Research Council. Committee on Metagenomics C, Functional A. New science of metagenomics: revealing the secrets of our microbial planet. Washington, DC: National Academies Press; 2007.

14. http://www.metahit.eu/.

15. http://www.metagenome.ru/.

16. Огородова Л. М., Говорун В. М., Федосенко С. В., Карнаушкина М. А., Салтыкова И. В., Алексеев Д. Г., Попенко А. С. Особенности микробиоты кишечника у больных хронической обструктивной болезнью легких // Бюллетень сибирской медицины. 2014; 13 (5): 55-61.

17. Федосенко С. В., Огородова Л. М., Карнаушкина М. А., Куликов Е. С., Деев И. А., & Кириллова Н. А. Роль сообщества микроорганизмов дыхательных путей в патогенезе хронической обструктивной болезни легких // Бюллетень сибирской медицины. 2014; 13 (1): 153-160.

18. Filion M. Quantitative Real-time PCR in Applied Microbiology. Caister Academic Press: Canada, 2012. 242 р.

19. Qin J., Li R., Raes J. et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing // Nature. 2010; 464: 59-65.

20. Backhed F., Ding H., Wang T. et al. The gut microbiota as an environmental factor that regulates fat storage // Proc Natl Acad Sci USA. 2004, Nov 2; 101 (44): 15718-15723.

21. Резник Н. Л. Внутренний мир // Химия и жизнь. 2013; 8: 8-12.

22. Marsh R. L., Nelson M. T., Pope C. E. et al. How low can we go? The implications of low bacterial load in respiratory microbiota studies // Pneumonia (Nathan). 2018, Jul 5; 10: 7. DOI: 10.1186/s41479-018-0051-8.

23. Giavina-Bianchi P., Aun M. V., Takejima P. et al. United airway disease: current perspectives // J Asthma Allergy. 2016, May 11; 9: 93-100. DOI: 10.2147/JAA.S81541.

24. Bousquet J., Khaltaev N., Cruz A. A. et al. Allergic rhinitis and its impact on asthma (ARIA) 2008 // Allergy. 2008; 63 (86): 8-16.

25. Захарова И. Н., Касьянова А. Н., Климов Л. П. и др. Микробиом респираторного тракта: что известно сегодня? // Педиатрия. Прил.к журн. Consilium medicum). 2018; 4: 10-17. DOI:10.26442/24138460.2018.4.180129).

26. Salzano F. A., Marino L., Salzano G. et al. Microbiota Composition and the Integration of Exogenous and Endogenous Signals in Reactive Nasal Inflammation // J Immunol Res. 2018, Jun 3; 2018: 2724951. DOI: 10.1155/2018/2724951.

27. Stokholm J., Blaser M. J., Thorsen J. et al. Maturation of the gut microbiome and risk of asthma in childhood // Nat Commun. 2018 Jan 10; 9 (1): 141. DOI: 10.1038/s41467-017-02573-2.

28. Lambrecht B. N., Hammad H. The immunology of the allergy epidemic and the hygiene hypothesis // Nat Immunol. 2017 Sep 19; 18 (10): 1076-1083. DOI: 10.1038/ni.3829.

29. Hilty M., Burke C., Pedro H. et al. Disordered microbial communities in asthmatic airways // PLoS One. 2010; 5: e8578.

30. Bassis C. M., Tang A. L., Young V. B., Pynnonen M. A. The nasal cavity microbiota of healthy adults // Microbiome 2014. Aug 11; 2: 27. DOI: 10.1186/2049-2618-2-27.

31. Chalermwatanachai T., Vel?squez L. C., Bachert C. The microbiome of the upper airways: focus on chronic rhinosinusitis // World Allergy Organ J. 2015, Jan 27; 8 (1): 3. DOI: 10.1186/s40413-014-0048-6.

32. Fazlollahi M., Lee T. D., Andrade J. et al. The nasal microbiome in asthma // J Allergy Clin Immunol. 2018 Sep; 142 (3): 834-843. DOI: 10.1016/j.jaci.2018.02.020.

33. Charlson E. S. Bittinger K., Haas A. R. et al. Topographical continuity of bacterial populations in the healthy human respiratory tract // Am J Respir Crit Care Med. 2011, Oct 15; 184 (8): 957-63.

34. Teo S. M., Mok D., Pham K. et al. The infant nasopharyngeal microbiome impacts severity of lower respiratory infection and risk of asthma development // Cell Host Microbe. 2015, May 13; 17(5): 704-15. DOI: 10.1016/j.chom.2015.03.008.

35. Anderson M., Stokken J., Sanford T. et al. A systematic review of the sinonasal microbiome in chronic rhinosinusitis // Am J Rhinol Allergy. 2016, May; 30 (3): 161-166. DOI: 10.2500/ajra.2016.30.4320.

36. Venkataraman A., Bassis C. M., Beck J. M. et al. Application of a neutral community model to assess structuring of the human lung microbiome // MBio. 2015; 6: e02284-14.

37. Bassis C. M., Erb-Downward J. R., Dickson R. P. et al. Analysis of the upper respiratory tract microbiotas as the source of the lung and gastric microbiotas in healthy individuals // MBio. 2015, Mar 3; 6 (2): e00037. DOI: 10.1128/mBio.00037-15.

38. Gleeson K., Eggli D. F., Maxwell S. L. Quantitative aspiration during sleep in normal subjects // Chest. 1997; 111: 1266-72.

39. Segal L. N., Alekseyenko A. V., Clemente J. C. et al. Enrichment of lung microbiome with supraglottic taxa is associated with increased pulmonary inflammation // Microbiome. 2013; 1: 19.

40. Sokolowska M., Frei R., Lunjani N., Akdis C. A., O’Mahony L. Microbiome and asthma // Asthma Res Pract. 2018, Jan 5; 4: 1. DOI: 10.1186/s40733-017-0037-y.

41. Huang Y. J., Nariya S., Harris J. M. et al. The airway microbiome in patients with severe asthma: associations with disease features and severity // J Allergy Clin Immunol. 2015; 136: 874-884. DOI: 10.1016/j.jaci.2015.05.044

42. Carr T. F., Kraft M. Chronic infection and severe asthma // Immunol Allergy Clin N Am. 2016; 36: 483-502. DOI: 10.1016/j.iac.2016.03.010;

43. Carr T. F., Alkatib R., Kraft M. Microbiome in Mechanisms of Asthma // Clin Chest Med. 2019, Mar; 40 (1): 87-96. DOI: 10.1016/j.ccm.2018.10.006.

44. Goleva E., Jackson L. P., Harris J. K. et al. The effects of airway microbiome on corticosteroid responsiveness in asthma // Am J Respir Crit Care Med. 2013; 188: 1193-1201.

45. Durack J., Lynch S. V., Nariya S. et al. Features of the bronchial bacterial microbiome associated with atopy, asthma, and responsiveness to inhaled corticosteroid treatment // J Allergy Clin Immunol. 2017; 140: 63-75, DOI: 10.1016/j.jaci.2016.08.055.

46. Turturice B. A., McGee H. S., Oliver B. et al. Atopic asthmatic immune phenotypes associated with airway microbiota and airway obstruction // PLoS One. 2017, Oct 20; 12 (10): e0184566.

47. Frati F., Salvatori C., Incorvaia C. et al. The Role of the Microbiome in Asthma: The GutLung Axis // Int J Mol Sci. 2018, Dec 30; 20 (1). pii: E123. DOI: 10.3390/ijms20010123.

48. Mitchell A. B., Glanville A. R. The Human Respiratory Microbiome: Implications and Impact // Semin Respir Crit Care Med. 2018, Apr; 39 (2): 199-212. DOI: 10.1055/s-0037-1617441.

49. Holgate S. T. The airway epithelium is central to the pathogenesis of asthma // Allergol Int. 2008, Mar; 57 (1): 1-10.

50. Izuhara K., Nunomura S., Nanri Y. et al. Periostin in inflammation and allergy // Cell Mol Life Sci. 2017 Dec; 74 (23): 4293-4303. DOI: 10.1007/s00018-017-2648-0.

51. Doherty T. A. At the bench: understanding group 2 innate lymphoid cells in disease // J Leukoc Biol. 2015, Mar; 97 (3): 455-467.

52. Diefenbach A., Colonna M., Koyasu S. Development, Differentiation, and Diversity of Innate Lymphoid Cells // Immunity. 2014, Sep 18; 41(3): 354-365. DOI: 10.1016/j.immuni.2014.09.005.

53. Montaldo E., Vacca P., Vitale C. et al. Human innate lymphoid cells // Immunology Letters. 2016; 179: 2-8.

54. Yazdani R., Sharifi M., Shirvan A. S. et al. Characteristics of innate lymphoid cells (ILCs) and their role in immunological disorders (an update) // Cell Immunol. 2015, Nov-Dec; 298 (1-2): 66-76.

55. Hepworth M. R., Monticelli L. A., Fung T. C. et al. Innate lymphoid cells regulate CD4+ T-cell responses to intestinal commensal bacteria // Nature. 2013, Jun 6; 498 (7452): 113-7. DOI: 10.1038/nature12240.

56. Астафьева Н. Г., Гамова И. В., Удовиченко Е. Н., Перфилова И. А., Кобзев Д. Ю., Михайлова И. Э. Иммунная система слизистых: возможности регуляторного действия пробиотиков // РАЖ. 2015; 5: 17-30.

57. Wang H. T., Anvari S., Anagnostou K. The Role of Probiotics in Preventing Allergic Disease // Children (Basel). 2019, Feb 5; 6 (2). pii: E24. DOI: 10.3390/children6020024.

58. Fiocchi A., Pawankar R., Cuello-Garcia C. A. et al. World Allergy Organization-McMaster University Guidelines for Allergic Disease Prevention (GLAD-P): Probiotics // World Allergy Organ J. 2015, Jan 27; 8 (1): 4.


Рецензия

Для цитирования:


Астафьева Н.Г., Кобзев Д.Ю., Гамова И.В., Перфилова И.А., Удовиченко Е.Н., Скучаева Л.В., Михайлова И.Э. Роль микробиома дыхательных путей в респираторном здоровье. Лечащий Врач. 2019;(5):88.

For citation:


Astafieva N.G., Kobzev D.Yu., Gamova I.V., Perfilova I.A., Udovichenko E.N., Skuchaeva L.V., Michailova I.E. The role of the respiratory tract microbiome in respiratory health. Lechaschi Vrach. 2019;(5):88. (In Russ.)

Просмотров: 71


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International.


ISSN 1560-5175 (Print)
ISSN 2687-1181 (Online)