Лазарева Елена Николаевна, д.м.н., ведущий сотрудник клинического отдела инфекционной патологии
111123, Москва, ул. Новогиреевская, 3а
Elena N. Lazareva, Dr. of Sci. (Med.), Senior Researcher, Clinical Department of Infectious Diseases
3a Novogireevskaya str., Moscow, 111123
Малеев Виктор Васильевич, д.м.н., профессор, академик РАН, советник директора по научной работе
111123, Москва, ул. Новогиреевская, 3а
Viktor V. Maleev, Dr. of Sci. (Med.), Professor, Academician of the Russian Academy of Sciences, Advisor to the Director of Scientific Work, Clinical Department of Infectious Diseases
3a Novogireevskaya str., Moscow, 111123
Понежева Жанна Бетовна, д.м.н., заведующая клиническим отделом инфекционной патологии
111123, Москва, ул. Новогиреевская, 3а
Zhanna B. Ponezheva, Dr. of Sci. (Med.), Head of the Clinical Department of Infectious Diseases
3a Novogireevskaya str., Moscow, 111123
Швачкина Наталья Сергеевна, инфекционист
105275, Москва, 8-я ул. Соколиной горы, 15
Natalya S. Shvachkina, Infectious diseases specialist
15 8th Sokolinaya Gora str., Moscow, 105275
Цветкова Наталья Александровна, заместитель главного врача по медицинской части
105275, Москва, 8-я ул. Соколиной горы, 15
Natalya A. Tsvetkova, Deputy Chief Physician for the Medical Department
15 8th Sokolinaya Gora str., Moscow, 105275
Введение. Для COVID-19 характерна мультиморбидность с поражением не только органов дыхания, но и сердечно-сосудистой, мочевыделительной и нервной систем и желудочно-кишечного тракта. Клинические симптомы заболевания объединены в гастроинтестинальный синдром, регистрируемый в 30-79% случаев. При этом начало болезни может сопровождаться диареей у 50% пациентов и как сочетаться с катаральными явлениями со стороны носоглотки, так и предшествовать им. Цель работы. Оценить особенности микробиоты кишечника у больных COVID-19, в том числе при поражении желудочнокишечного тракта.
Материалы и методы. У 85 больных с диагнозом «новая коронавирусная инфекция» оценили количественный состав микробиоты кишечника по числу копий микроорганизмов, выявленных методом полимеразной цепной реакции с применением тест-системы ЭНТЕРОФЛОР.
Результаты. Исследование структурного состава микробиома кишечника показало, что у пациентов с диареей наблюдается статистически значимое превышение числа копий Bifidobacterium longum subsp. infantis, Bifidobacterium longum subsp. longum и Bifidobacterium breve на фоне снижения Bifidobacterium spp., Bifidobacterium adolescentis, Bifidobacterium bifidum и Bifidobacterium сatenulatum. Из представителей грамотрицательных комменсалов активность проявляли Butyricimonas spp. Среди условнопатогенной и патогенной флоры отмечали возрастание числа копий Enterobateriaceae преимущественно у больных с диарей. У них же чаще идентифицировали штаммы Staphylococcus aureus с геном резистентности mecA и Clostridium dificile с генами сdtA и cdtB. Была установлена прямая корреляционная связь между C. dificile и Butyricimonas spр., а также обратная – между B. сatenulatum и C. dificile сdtA и cdtB и между Bifidobacterium spp. и S. aureus mecA.
Заключение. Среди комменсалов наблюдается уменьшение грамположительных в пользу грамотрицательных микроорганизмов. Снижение B. adolescentis и полное отсутствие B. bifidum и B. catenulatum у больных COVID-19 с диареей указывает на формирование воспалительных процессов в кишечнике. Переход на аэробный метаболизм позволяет Enterobateriaceae получать конкурентное преимущество по отношению к полезным облигатным анаэробам с ростом штаммов, содержащих гены резистентности.
Background. COVID-19 is characterised by multimorbidity with involvement of not only respiratory organs, but also cardiovascular, urinary and nervous systems and gastrointestinal tract. Clinical symptoms of the disease are united in the gastrointestinal syndrome, registered in 30-79% of cases. The onset of the disease may be accompanied by diarrhoea in 50% of patients and may be combined with or preceded by nasopharyngeal catarrhal symptoms.
Objective. To evaluate the features of the intestinal microbiota in patients with COVID-19, including those affected by the gastrointestinal tract.
Materials and methods. In 85 patients diagnosed with a new coronavirus infection, the quantitative composition of the intestinal microbiota was assessed by the number of copies of microorganisms detected by PCR using the ENTEROFLOR test system.
Results. A study of the structural composition of the intestinal microbiome has shown that patients with diarrhea have a statistically significant excess of copies of B. longum subsp. infantis, Bif. longum subsp. longum and B. breve against the background of a decrease in Bifidobacterium spp., B. adolescentis, B. bifidum and B. senulatum. Of the representatives of gram-negative commensals, Butyricimonas spp. was active. Among the opportunistic and pathogenic flora, an increase in the number of copies of Enterobateriaceae was noted, mainly in patients with diarrhea. They also more often identified S. aureus strains with mecA and C. dificile with resistance genes cdtA and сdtB. A direct correlation was established between C. dificile and Butyricimonas spp., as well as an inverse correlation between B. catenulatum and C. dificile cdtA and сdtB, and between Bifidobacterium spp. and S. aureus mecA.
Conclusion. There is a decrease in gram-positive microorganisms among the commensals in favor of gram-negative microorganisms. Reduction of B. adolescentis and complete absence of B. bifidum and B. catenulatum in COVID-19 patients with diarrhea indicate the formation of inflammatory processes in the intestine. The transition to aerobic metabolism allows Enterobateriaceae to compete with beneficial obligate anaerobes, with the growth of strains containing resistance genes.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.